Masaru je student druge godine niže srednje škole i nepobjediv je u borbi. Upoznaje digitalno čudovište Agumona, koji je pobjegao iz DATS-a, tajne vladine organizacije. Unatoč strašnim prvim dojmovima, njih dvoje postaju najbolji prijatelji razgovarajući šakama. S drugima, Masaru i Agumon rade na istraživanju raznih incidenata koji uključuju Digitalni svijet i digitalna čudovišta, pokušavajući doći do srži stvari.